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技術文章

賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR系統熒光信號漂移是怎么回事?

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QuantStudio 1,熒光信號漂移(比如基線不穩、ROX參比熒光異常上升或下降、陰性對照出現假陽性擴增曲線等),常見原因和解決方案如下:


一、可能的原因:耗材與熱蓋問題

這是QuantStudio系列(包括入門級QS1)最常見的故障源。

1、PCR管/板密封不嚴,反應體系蒸發

(1)現象:反應液體積減少,導致熒光染料(如SYBR Green、TaqMan探針)或ROX參比染料濃度被動升高,造成擴增曲線末段上揚或整條線漂移。

(2)檢查:反應結束后,肉眼檢查8連管或96孔板封板膜是否平整,各孔液面高度是否一致。

(3)解決:

使用賽默飛推薦的封板膜(如MicroAmp Optical Adhesive Film)。

壓膜時確保無氣泡,邊緣壓實。

檢查熱蓋壓力是否適當(熱蓋旋鈕旋緊至聽到“咔噠"一聲停止)。

2、耗材與儀器不匹配

(1)現象:使用非推薦的PCR管/板,導致光路讀取位置不準,或熱蓋無法均勻壓緊。

(2)解決:QuantStudio 1推薦使用MicroAmp Fast 96孔反應板(0.1mL) 和對應的光學封板膜。避免使用0.2mL標準板或其它品牌的薄壁管。


二、光學系統問題

1、ROX參比熒光信號漂移

(1)原理:ROX用于校正非PCR相關的熒光波動(如蒸發、加樣誤差)。如果ROX信號異常漂移,說明物理環境不穩定。

(2)現象:ROX原始曲線在早期循環出現下降,然后平穩;或持續上升/下降。

(3)解決:

確認反應體系中是否正確添加了ROX(不同試劑要求不同濃度,如SYBR Green試劑通常已預混)。

在軟件分析設置中,確認選擇了正確的ROX校正模式(通常為“Passive Reference"或“None",取決于試劑說明書)。

若ROX信號仍異常,運行一次背景校正(Background Calibration)和純染料校正(Pure Dye Calibration)。

2、光源或檢測器老化/污染

(1)現象:所有孔的某個特定熒光通道都出現漂移,且漂移方向一致。

(2)檢查:運行儀器自帶的RNase P驗證板(Instrument Verification Plate)。如果驗證板結果異常,說明是硬件問題。

(3)解決:聯系賽默飛工程師進行光路清潔或部件更換。


三、反應體系與程序問題

1、初始循環的基線設置不當

(1)現象:數據分析時,基線范圍(Baseline)包含了擴增早期的微弱信號上升,導致歸一化后的曲線漂移。

(2)解決:手動調整基線。通常將基線起點設為循環3(Cycle 3),終點設為循環15-18(比最早出現的陽性樣本Ct值提前2-4個循環)。不要使用自動基線。

2、試劑質量問題

(1)現象:陰性對照(NTC)出現緩慢上升的“煙囪曲線"或漂移。

(2)原因:試劑中的DNA污染、引物二聚體形成、或熒光染料降解。

(3)解決:更換新批次或不同品牌的qPCR預混液;使用UNG酶防止殘留污染。


四、操作排查建議

1、先看ROX信號:在軟件中查看原始熒光(Raw Fluorescence)曲線。如果ROX通道(通常為橙色/紅色)也漂移,90%是蒸發或封板問題。如果ROX平穩,僅目標染料漂移,可能是光學或基線問題。

2、檢查封板膜:運行結束后立即檢查,是否有孔未密封好。可以用手輕按膜表面,若有液體滲出說明蒸發嚴重。

3、運行自檢:執行儀器上的“光學系統自檢"(Optical Self-Test)和“背景校準"。具體路徑在QuantStudio Design & Analysis Software的“Instrument"菜單下。


五、總結建議

對于QuantStudio 1,常見的熒光漂移原因是:

1、封板膜不嚴導致的蒸發(尤其是96孔板的邊緣孔)。

2、基線設置范圍不合理。

3、使用了不兼容的耗材。

TEL:18016231680

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